作物生物技术系成立于2005年，其前身为独立设院时的遗传学教研室。经过多年的院系优化与高端人才引进，现已发展成为国内农业生物技术领域的重要力量。目前，本系拥有44名师资，全部具有博士学位，其中包括教授19人、副教授15人、讲师8人和助理研究员2人。师资队伍由教育部长江学者和国家万人领军人才领衔，包括长江学者奖励计划1人，国家“万人计划”领军人才2人，新世纪百千万人才工程国家级人选2人，农业部“神农英才”计划领军和青年英才各1人，中国科协青年托举人才1人，中原学者1人，中原基础研究领军人才2人，河南省特聘教授5人等国家和河南省高层次人才。师资力量雄厚，学缘结构合理，整体素质优良，在教学、科研等方面展现出强劲的发展势头，已成为一支兼具国际视野与产业实践能力的现代农业科研中坚力量。
       依托本系设有生物育种科学本科专业，授予理学学位，旨在培养拔尖创新型人才。本专业以“厚基础、强交叉、重创新”为理念，构建本硕博贯通式人才培养体系。本系承担农学（创新班）、农学、烟草、种子科学与工程、生物育种、智慧农业、中药学和植物保护等8大特色本科专业以及硕士和博士层次的教育教学任务，开设19门核心课程，涵盖从经典遗传学、分子育种学到植物基因组学等前沿领域。其中，《遗传学》被评为校级精品课程，独创“实验室+田间”双轨教学模式，与北京奥瑞金、河南省农科院、河南金沃野农业发展有限公司等单位机构共建实践基地，让学生作物基础研究实验室与万亩良田之间无缝切换，锻造“顶天立地”的科研能力。
       近五年，本系主持国家及省级重大科研项目40余项，在《Science》、《Nature Genetics》等顶刊发表科研论文150余篇，出版教材和专著5部，科研影响力不断提升。自主培育并审定国家和省级农作物新品种20余个，其中玉米品种MY73，2023年推广面积达2088万亩，问鼎全国种植面积榜首；玉米品种YD268以2680万元转让费刷新行业纪录，彰显科技成果转化的“黄金价值”。国际首次破译花生野生四倍体基因组和三维基因组图谱，培育高产高蛋白高油酸突破性花生新品系6个，育成农大花103、农大花201等高产优质花生新品种8个。获得教育部高等学校科学研究优秀成果奖一等奖1项，省部级科技奖励一等奖5项等，河南省教育厅科技成果奖一等奖、二等奖各1项。
       作物生物技术系始终致力于农业生物技术领域的研究与创新，通过不断优化师资队伍和科研平台，取得了显著的科研成果和社会效益。未来，本系将继续秉承“厚基础、强交叉、重创新”的理念，深化教育教学改革，加强科研创新，推动科技成果转化，为农业现代化和乡村振兴贡献更多智慧和力量。